2006年6月30日 國務院第141次常務會議決定成立由國家發(fā)展改革委和衛(wèi)生部牽頭，財政部、原人事部等部門參加的深化醫(yī)藥衛(wèi)生體制改革部際協(xié)調(diào)工作小組。主要任務研究提出深化醫(yī)藥衛(wèi)生體制改革的總體思路和政策措施，標志新一輪醫(yī)改研究制定工作正式啟動。

2006年8月17日 工作小組召開第一次會議。明確了第一階段工作，分為管理和運行機制、衛(wèi)生投入機制、醫(yī)療保障體制和藥品市場監(jiān)管四個專題研究組。

2006年9月26日 工作小組在國家發(fā)展改革委官方網(wǎng)站主頁上開通“我為醫(yī)改建言獻策”欄目，并公布了熱線電話，聽取社會各界的意見和建議。

2007年3月23日 工作小組委托世界銀行、世界衛(wèi)生組織、國務院發(fā)展研究中心、北京大學、復旦大學、麥肯錫（中國）公司和北京師范大學等七家國內(nèi)外機構(gòu)開展“中國醫(yī)藥衛(wèi)生體制改革總體思路和框架設計”的獨立平行研究。

2007年9月28日 工作小組辦公室召開會議，討論修改《關(guān)于深化醫(yī)藥衛(wèi)生體制改革的總體方案（征求意見稿）》。

2008年1月14日、15日  國務院原副總理吳儀兩次主持座談會，分別聽取全國人大教科文衛(wèi)委員會和全國政協(xié)教科文衛(wèi)體委員會部分委員對工作小組關(guān)于深化醫(yī)藥衛(wèi)生體制改革指導意見的建議意見。

2008年2月29日 國務院常務會議聽取工作小組關(guān)于醫(yī)改方案的匯報，根據(jù)與會國務院領(lǐng)導的意見，對醫(yī)改方案進行進一步修改，形成了《關(guān)于深化醫(yī)藥衛(wèi)生體制改革的意見（征求意見稿）》。

2008年4月11日和15日 溫家寶總理在中南海兩次主持召開醫(yī)改工作座談會，就醫(yī)改征求意見稿聽取醫(yī)務工作者、專家學者、藥品生產(chǎn)和流通企業(yè)負責人、教師、城鎮(zhèn)居民、農(nóng)民、農(nóng)民工等群眾代表的意見和建議。

2008年9月10日 溫家寶總理主持召開國務院常務會議審議并原則通過了《關(guān)于深化醫(yī)藥衛(wèi)生體制改革的意見（征求意見稿）》，并決定公開向社會征求意見。

2008年10月14日 發(fā)改委公布《關(guān)于深化醫(yī)藥衛(wèi)生體制改革的意見（征求意見稿）》，新一輪醫(yī)改大方向逐漸明朗。

2009年1月21日  國務院常務會議再次審議并原則通過了《關(guān)于深化醫(yī)藥衛(wèi)生體制改革的意見》和《2009－2011年深化醫(yī)藥衛(wèi)生體制改革實施方案》。

2009年4月6日 國務院正式公布《中共中央國務院關(guān)于深化醫(yī)藥衛(wèi)生體制改革的意見》。